CheckCIF中遇到的警告 (持续更新)

CheckCIF中遇到的警告常见解决办法

PLAT213_ALERT_2_A Atom C01Q has ADP max/min Ratio ..... 26.6 prolat 该原子非正定,各向异性数据不好,尝试对该原子添加限制条件,在ins文件中添加 ```ISOR 0.01 C01Q``` 再进行精修。
PLAT934_ALERT_3_A Number of (Iobs-Icalc)/Sigma(W) > 10 Outliers .. 14 Check 在Olex2软件(点击查看Olex2安装使用)标签Info-Bad Reflections中将标红的数据点击该行的omit进行数据删除,然后再进行精修。
PLAT919_ALERT_3_B Reflection # Likely Affected by the Beamstop ... 5 警告原因:有些低角度衍射点拟合误差较大,可能是由于仪器的原因(需上传fcf文件) 在lst文件中找出误差大的点,OMIT掉即可。 去LST文件里: Most Disagreeable Reflections (* if suppressed or used for Rfree) 下面找到前两组的HKL 去ins文件里填写如下命令后精修即可 OMIT H1 K1 L1 OMIT H2 K2 L2 若使用OLEX2,则可以直接在“Bad Reflections”菜单栏(下图所示)中将误差大的衍射点OMIT。
PLAT234_ALERT_4_A Large Hirshfeld Difference C4BA -- C0AA .. 0.32 Ang. 警告原因:上述化学键无法通过刚性键检查。 解决策略:如果仅是个别原子不正常,检查原子类型是否定错,是否需要无序处理,或采用DELU(DELU 0.01 0.02 C4BA C0AA)或者ISOR限制精修;如果整体温度因子不正常,检查数据质量是否足够高,或者定错空间群。(DELU 限制所指定的原子具有接近指定范围内的位移参数,0.02 0.01必须成倍数关系)
PLAT242_ALERT_2_B Low Ueq as Compared to Neighbors for ..... N8 警告原因:某原子同附近原子相比,温度因子较高或者较低。 解决策略:如果仅是个别原子不正常,检查原子类型是否定错,是否需要无序处理,或采用DELU或者ISOR限制精修;如果整体温度因子不正常,检查数据质量是否足够高。
PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 3.83 Ratio 警告原因:非溶剂的碳原子或者氢最大温度因子和最小温度因子相差过大。 解决策略:一般都是末端基团及所连的氢温度因子过大,做无序处理即可,无法解决做合理解释即可。或者使用“SIMU 0.01 0.02 3.8 $C”命令(SIMU限制在一定范围内的原子具有相同的位移参数,0.01 0.02必须成倍数关系)。如果是衍射数据质量不够好而无法得到好的修正结果,那只有重新采集数据了。
The Flack x is >> 0 - Do a BASF/TWIN Refinement Please Check! ins文件中加入
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twin
basf 0.5