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Multiwfn与VMD安装说明

参考链接

Multiwfn软件下载及使用手册:Mutliwfn官网

计算化学公社:论坛官网

思想家公社:博客官网

VMD下载:官网

Mutiwfn安装及设置

Multiwfn下载后直接解压,然后修改配置文件settings.ini,将Below are the parameters about system environment中的设置按照自己的需求进行修改,例如CPU线程数nthreads以及Gaussian的相关路径设置,如果没有安装Gaussian可以不用设置。Windows下使用直接点击Multiwfn.exe即可,CentOS下需要修改系统环境变量文件.bashrc(root用户为文件/etc/profile)然后终端输入命令Multiwfn进行调用,具体添加参数如下:

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#Multiwfn 路径为软件所在目录名, KMP_STACKSIZE为软件允许调用的内存
export KMP_STACKSIZE=2000M
export Multiwfnpath=/home/user/Multiwfn37
export PATH=$PATH:/home/user/Multiwfn37
ulimit -s unlimited

确认修改并退出,重新进入终端界面使环境变量生效,或者直接在终端输入source /home/user/.bashrc(root用户输入source /etc/profile)使环境变量生效。 Multiwfn提供很多脚本文件(位于/Multiwfn/examples/scripts/),Windows系统使用bat文件,CentOS系统使用sh文件。 Windows系统:将bat文件和响应的txt文件复制到Multiwfn软件目录中,bat文件中如果有路径设置,需要根据自己的实际安装路径进行修改;将vmd文件复制到VMD安装目录下。CentOS系统:将sh脚本复制到计算结果目录下,并赋予文件执行权限。

VMD安装及设置

VMD(Windows系统)下载后直接点击安装即可,修改安装目录下vmd.rc文件,添加如下参数(命令简写、导入设置和软件启动默认设置):

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proc iso {} {source ESPiso.vmd}
proc iso2 {} {source ESPiso2.vmd}
proc pt {} {source ESPpt.vmd}
proc pt2 {} {source ESPpt2.vmd}
proc ext {} {source ESPext.vmd}
source showorb.vmd
source showcub.vmd
display depthcue off
color Display Background white
axes location Off