参考链接
Multiwfn软件下载及使用手册:Mutliwfn官网
计算化学公社:论坛官网
思想家公社:博客官网
VMD下载:官网
Mutiwfn安装及设置
Multiwfn下载后直接解压,然后修改配置文件settings.ini,将Below are the parameters about system environment中的设置按照自己的需求进行修改,例如CPU线程数nthreads以及Gaussian的相关路径设置,如果没有安装Gaussian可以不用设置。Windows下使用直接点击Multiwfn.exe即可,CentOS下需要修改系统环境变量文件.bashrc(root用户为文件/etc/profile)然后终端输入命令Multiwfn进行调用,具体添加参数如下:
1 | #Multiwfn 路径为软件所在目录名, KMP_STACKSIZE为软件允许调用的内存 |
确认修改并退出,重新进入终端界面使环境变量生效,或者直接在终端输入source /home/user/.bashrc
(root用户输入source /etc/profile
)使环境变量生效。 Multiwfn提供很多脚本文件(位于/Multiwfn/examples/scripts/),Windows系统使用bat文件,CentOS系统使用sh文件。 Windows系统:将bat文件和响应的txt文件复制到Multiwfn软件目录中,bat文件中如果有路径设置,需要根据自己的实际安装路径进行修改;将vmd文件复制到VMD安装目录下。CentOS系统:将sh脚本复制到计算结果目录下,并赋予文件执行权限。
VMD安装及设置
VMD(Windows系统)下载后直接点击安装即可,修改安装目录下vmd.rc文件,添加如下参数(命令简写、导入设置和软件启动默认设置):
1 | proc iso {} {source ESPiso.vmd} |