记录平时使用Olex2解析单晶过程中常用的指令或技巧。
点击查看Olex2安装与使用及checkcif警告处理方法。
分辨率截取
1 | shel 999 0.84 |
或
1 | omit -3 50 |
加氢
氧原子已有两个键将无法加氢，通过取消键，使得氧原子能够使用hadd自动加氢：
1 | 快捷键取消 Ctrl+Shift+/ |
选中所有C原子
1 | sel $C |
常用限制命令
使用时，选中对应的原子或键，输入对应的命令。
1 | 芳香五元环：AFIX 56 |
显示与作图
最小结构单元操作：compaq -a/-c/-q/-m
无序相关操作
固定整个分子做无序操作：part -1 -c
整个分子无序，特殊位置的原子需要偏离特殊位置：part -1 10.5
选中无序组分1：sel part 1
显示无序组分1：showp 0 1
取消无序：part 0 11
双组分无序：
1 | part 1 |
三组分无序：
1 | part 1 |